根據物流信息化系統的應用范圍，將物流行業IT應用系統分為四個層次。第一層次:單點應用單點應用是針對個別功能的各種軟件工具和單點系統的建設。
這一層次的主要建設內容包括辦公軟件、企業郵箱之類的通用工具軟件以及物流行業專用的條碼器、自動識別軟件、物流仿真軟件等工具軟件或單點系統等。通過使用電子數據交換系統(EDI)，使運輸、保管、裝卸搬運、包裝等各功能環節之間實現了數據的快速、批量傳送，特別是各部門、各種運輸工具、各種類型單位之間的橫向數據交換。該層次應用的主要任務就是為決策提供及時、準確的信息。
第二層次:流程優化
流程優化是針對物流企業的個別業務流程或管理職能，實施部門級的信息系統建設。該層次的信息化建設內容既包括一般企業通用的信息系統，也包括物流企業專用的信息系統。流程優化是將系統論和優化技術用于物流的流程設計和改造，融入新的管理制度之中。一方面可以固化新的流程或新的管理制度，使其得以規范地貫徹執行；另一方面在規定的流程中提供優化的操作方案，例如倉儲存取的優化方案、運輸路徑的優化方案等。此時信息系統作用主要在于固化管理和優化操作。此類信息化建設涉及流程，因此帶有明顯的行業特點。
第三層次:綜合管理
該應用層次是針對整個企業的綜合管理，實施企業級的信息系統建設。該層次的信息化建設內容既包括一般企業通用的綜合管理信息系統，也包括物流行業專用的綜合管理信息系統。該應用層次通過對上下游企業的信息反饋服務來提高供應鏈的協調性和整體效益，如生產企業與銷售企業的協同、供應商與采購商的協同等。物流信息系統不僅是供應鏈的血液循環系統，也是中樞神經系統。供應鏈的基礎是建立互利的利益機制，但是這種機制需要一定的技術方案來保證，信息系統在這里的主要作用是實現這種互利機制的手段。
第四層次:公共平臺
該應用層次所要解決的問題是整個物流行業的信息化問題，如物流信息的發布與共享，物流行業與其他相關機構的信息交互。這些信息化需求不可能由某一家物流企業單獨承擔，而應該由外部的服務供應商或政府部門負責滿足。這一層次的建設內容主要包括：物流公共信息交換平臺、全球定位系統、地理信息系統、EDI網絡服務中心等。
基于Internet的公共物流信息平臺真正實現了物流企業之間、企業與客戶之間的物流信息和物流功能的共享。平臺通過Internet可以將分布在不同地區的若干家物流企業連接在一起，遠程進行業內信息發布和業務數據傳輸；系統通過公網將各地用戶的訂單匯總起來，由信息平臺根據物流資源統一調控，通過規模物流，做到以最低的成本為客戶提供最好的服務；為客戶提供全面的物流信息，以及個性化的物流服務。
未來，隨著物流國際化、物流智能化的發展以及現代高新技術的迅速發展，物流管理將會朝著機械化、自動化、智能化方向發展，物流信息化的高級應用必然會更加廣泛，更加深入。
